Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC173Q0VFZ6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms