Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GABPAQ06546 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms