Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A2Q05940 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms