Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBE1Q04446 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms