Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN2Q02246 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms