Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms