Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms