Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AFDNP55196 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AFDNP55196 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AFDNP55196 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AFDNP55196 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AFDNP55196 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
AFDNP55196 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AFDNP55196 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AFDNP55196 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AFDNP55196 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AFDNP55196 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AFDNP55196 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFDNP55196 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFDNP55196 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFDNP55196 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFDNP55196 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFDNP55196 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFDNP55196 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFDNP55196 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFDNP55196 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AFDNP55196 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AFDNP55196 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFDNP55196 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFDNP55196 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFDNP55196 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFDNP55196 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFDNP55196 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFDNP55196 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFDNP55196 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFDNP55196 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFDNP55196 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFDNP55196 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFDNP55196 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFDNP55196 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFDNP55196 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFDNP55196 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFDNP55196 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFDNP55196 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFDNP55196 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFDNP55196 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFDNP55196 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFDNP55196 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFDNP55196 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AFDNP55196 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFDNP55196 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFDNP55196 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFDNP55196 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFDNP55196 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFDNP55196 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFDNP55196 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFDNP55196 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFDNP55196 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFDNP55196 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFDNP55196 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AFDNP55196 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFDNP55196 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFDNP55196 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFDNP55196 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFDNP55196 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFDNP55196 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFDNP55196 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AFDNP55196 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AFDNP55196 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AFDNP55196 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AFDNP55196 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AFDNP55196 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms