Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPR4P46093 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR4P46093 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR4P46093 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms