Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT2P45379 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms