Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPOP42166 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPOP42166 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPOP42166 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPOP42166 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPOP42166 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPOP42166 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPOP42166 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPOP42166 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPOP42166 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPOP42166 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPOP42166 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPOP42166 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPOP42166 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPOP42166 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPOP42166 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPOP42166 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPOP42166 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPOP42166 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPOP42166 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPOP42166 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPOP42166 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPOP42166 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPOP42166 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPOP42166 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPOP42166 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPOP42166 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPOP42166 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPOP42166 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPOP42166 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPOP42166 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPOP42166 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPOP42166 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPOP42166 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPOP42166 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPOP42166 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPOP42166 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPOP42166 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPOP42166 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPOP42166 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPOP42166 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPOP42166 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPOP42166 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPOP42166 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPOP42166 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPOP42166 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPOP42166 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPOP42166 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMPOP42166 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMPOP42166 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPOP42166 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPOP42166 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPOP42166 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPOP42166 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPOP42166 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPOP42166 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPOP42166 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPOP42166 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPOP42166 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPOP42166 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPOP42166 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPOP42166 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMPOP42166 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms