Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GGCXP38435 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGCXP38435 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGCXP38435 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGCXP38435 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGCXP38435 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGCXP38435 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGCXP38435 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGCXP38435 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGCXP38435 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGCXP38435 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GGCXP38435 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGCXP38435 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGCXP38435 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGCXP38435 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GGCXP38435 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GGCXP38435 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGCXP38435 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGCXP38435 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGCXP38435 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GGCXP38435 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGCXP38435 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGCXP38435 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGCXP38435 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGCXP38435 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGCXP38435 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGCXP38435 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGCXP38435 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGCXP38435 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGCXP38435 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGCXP38435 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGCXP38435 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGCXP38435 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGCXP38435 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGCXP38435 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGCXP38435 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGCXP38435 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGCXP38435 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGCXP38435 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGCXP38435 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGCXP38435 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGCXP38435 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGCXP38435 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGCXP38435 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGCXP38435 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGCXP38435 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGCXP38435 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGCXP38435 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGCXP38435 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGCXP38435 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGCXP38435 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGCXP38435 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGCXP38435 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGCXP38435 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGCXP38435 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGCXP38435 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGCXP38435 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGCXP38435 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGCXP38435 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGCXP38435 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms