Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PPARGP37231 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PPARGP37231 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PPARGP37231 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PPARGP37231 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PPARGP37231 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PPARGP37231 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PPARGP37231 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PPARGP37231 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PPARGP37231 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PPARGP37231 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PPARGP37231 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PPARGP37231 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PPARGP37231 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PPARGP37231 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PPARGP37231 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PPARGP37231 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PPARGP37231 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PPARGP37231 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PPARGP37231 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PPARGP37231 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PPARGP37231 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PPARGP37231 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PPARGP37231 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PPARGP37231 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PPARGP37231 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PPARGP37231 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PPARGP37231 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PPARGP37231 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PPARGP37231 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PPARGP37231 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PPARGP37231 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PPARGP37231 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PPARGP37231 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PPARGP37231 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PPARGP37231 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms