Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms