Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABCD1P33897 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms