Protein–RNA interactions for Protein: P31930

UQCRC1, Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCRC1P31930 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UQCRC1P31930 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms