Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TSPOP30536 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TSPOP30536 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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