Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5DP30049 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms