Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PVALBP20472 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PVALBP20472 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PVALBP20472 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PVALBP20472 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PVALBP20472 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PVALBP20472 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PVALBP20472 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PVALBP20472 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PVALBP20472 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PVALBP20472 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PVALBP20472 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PVALBP20472 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PVALBP20472 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PVALBP20472 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PVALBP20472 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PVALBP20472 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PVALBP20472 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PVALBP20472 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PVALBP20472 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PVALBP20472 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PVALBP20472 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms