Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DESP17661 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DESP17661 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DESP17661 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DESP17661 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DESP17661 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
DESP17661 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
DESP17661 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DESP17661 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DESP17661 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DESP17661 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DESP17661 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DESP17661 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DESP17661 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DESP17661 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DESP17661 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DESP17661 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DESP17661 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DESP17661 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DESP17661 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DESP17661 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DESP17661 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DESP17661 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DESP17661 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DESP17661 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DESP17661 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DESP17661 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DESP17661 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DESP17661 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DESP17661 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DESP17661 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DESP17661 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DESP17661 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms