Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms