Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPRP12270 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TPRP12270 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms