Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms