Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
JRKO75564 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
JRKO75564 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
JRKO75564 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
JRKO75564 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
JRKO75564 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
JRKO75564 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
JRKO75564 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
JRKO75564 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
JRKO75564 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
JRKO75564 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
JRKO75564 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
JRKO75564 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
JRKO75564 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
JRKO75564 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
JRKO75564 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JRKO75564 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
JRKO75564 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
JRKO75564 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
JRKO75564 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
JRKO75564 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
JRKO75564 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
JRKO75564 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
JRKO75564 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
JRKO75564 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
JRKO75564 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
JRKO75564 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
JRKO75564 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
JRKO75564 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
JRKO75564 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
JRKO75564 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
JRKO75564 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
JRKO75564 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
JRKO75564 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
JRKO75564 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
JRKO75564 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
JRKO75564 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
JRKO75564 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
JRKO75564 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
JRKO75564 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
JRKO75564 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
JRKO75564 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
JRKO75564 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
JRKO75564 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
JRKO75564 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
JRKO75564 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
JRKO75564 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
JRKO75564 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
JRKO75564 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
JRKO75564 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
JRKO75564 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
JRKO75564 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
JRKO75564 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
JRKO75564 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
JRKO75564 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
JRKO75564 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
JRKO75564 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
JRKO75564 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
JRKO75564 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
JRKO75564 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
JRKO75564 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms