Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EDIL3O43854 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms