Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBDO15205 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms