Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms