Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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LINC01387J3KSC0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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LINC01387J3KSC0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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LINC01387J3KSC0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC01387J3KSC0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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LINC01387J3KSC0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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LINC01387J3KSC0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LINC01387J3KSC0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LINC01387J3KSC0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01387J3KSC0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LINC01387J3KSC0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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