Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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