Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E9PBE3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms