Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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LINC00587B1AMM8 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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LINC00587B1AMM8 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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LINC00587B1AMM8 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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LINC00587B1AMM8 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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LINC00587B1AMM8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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LINC00587B1AMM8 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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LINC00587B1AMM8 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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LINC00587B1AMM8 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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LINC00587B1AMM8 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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LINC00587B1AMM8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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