Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NL46 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129 ms