Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms