Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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ARL2-SNX15V9GYD0 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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ARL2-SNX15V9GYD0 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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ARL2-SNX15V9GYD0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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ARL2-SNX15V9GYD0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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ARL2-SNX15V9GYD0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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