Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms