Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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