Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAK1Q9UPV9 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms