Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms