Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms