Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP35Q9P2H5 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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