Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms