Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT82Q9NSB4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms