Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB9BQ9NP90 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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RAB9BQ9NP90 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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