Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms