Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHACTR1Q9C0D0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms