Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms