Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CELF4Q9BZC1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CELF4Q9BZC1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CELF4Q9BZC1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CELF4Q9BZC1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CELF4Q9BZC1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CELF4Q9BZC1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CELF4Q9BZC1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CELF4Q9BZC1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CELF4Q9BZC1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CELF4Q9BZC1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CELF4Q9BZC1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CELF4Q9BZC1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CELF4Q9BZC1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CELF4Q9BZC1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CELF4Q9BZC1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CELF4Q9BZC1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CELF4Q9BZC1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CELF4Q9BZC1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CELF4Q9BZC1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CELF4Q9BZC1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CELF4Q9BZC1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CELF4Q9BZC1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CELF4Q9BZC1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CELF4Q9BZC1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CELF4Q9BZC1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CELF4Q9BZC1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CELF4Q9BZC1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms