Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms