Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms