Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF3

RBM4, RNA-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4Q9BWF3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RBM4Q9BWF3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms